Ngoài khả năng tiết kiệm nhiên liệu, Yaris Cross còn sở hữu nhiều công nghệ tiên tiến như gói công nghệ an toàn và hỗ trợ lái nâng cao Toyota Safety Sense, bao gồm cảnh báo tiền va chạm, cảnh báo lệch làn đường, hỗ trợ giữ làn đường, kiểm soát vận hành chân ga, cảnh báo phương tiện phía trước khởi hành, đèn chiếu xa tự động và ga tự động thông minh.