Bước sang phiên bản 2013, mẫu môtô địa hình Yamaha WR250R được bổ sung thêm màu và họa tiết trang trí mới.
Trước đây, Yamaha WR250R chỉ có màu đen. Ở phiên bản 2013, hãng Yamaha đã bổ sung thêm màu xanh dương và những họa tiết trang trí mới.
Độ cao gầm so với mặt đất ít nhất là 300 mm. Xe được trang bị yên cao 895 mm và có trọng lượng 132 kg.
Cung cấp năng lượng cho Yamaha WR250R 2013 là khối động cơ JBK-DG15J có dung tích 249 cc, xi-lanh đơn, 4 van, 4 kỳ, DOHC và phun nhiên liệu trực tiếp. Động cơ sản sinh công suất 31 mã lực tại 10.000 vòng/phút và mô-men xoắn cực đại 24 Nm tại 8.000 vòng/phút.
Theo kế hoạch, Yamaha WR250R 2013 sẽ bắt đầu được phân phối ra thị trường Nhật Bản vào ngày 30/8 tới. Tại Nhật, Yamaha WR250R 2013 có giá 701.400 Yên (tương đương 8.000 USD).